Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP12AP54707 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms