Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATN1P54259 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATN1P54259 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATN1P54259 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATN1P54259 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATN1P54259 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms