Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPAP53621 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPAP53621 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPAP53621 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPAP53621 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPAP53621 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPAP53621 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPAP53621 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPAP53621 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPAP53621 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms