Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2A2P52657 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms