Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms