Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GSK3BP49841 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GSK3BP49841 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms