Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP153P49790 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NUP153P49790 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NUP153P49790 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP153P49790 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP153P49790 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP153P49790 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP153P49790 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP153P49790 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NUP153P49790 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP153P49790 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP153P49790 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP153P49790 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP153P49790 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP153P49790 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NUP153P49790 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NUP153P49790 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP153P49790 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP153P49790 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP153P49790 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP153P49790 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NUP153P49790 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP153P49790 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP153P49790 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP153P49790 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP153P49790 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP153P49790 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP153P49790 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP153P49790 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP153P49790 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP153P49790 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP153P49790 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms