Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMTP48728 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMTP48728 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMTP48728 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMTP48728 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMTP48728 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AMTP48728 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMTP48728 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMTP48728 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMTP48728 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms