Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME1P48163 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ME1P48163 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ME1P48163 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ME1P48163 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ME1P48163 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ME1P48163 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME1P48163 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME1P48163 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ME1P48163 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ME1P48163 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ME1P48163 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms