Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCC3P46736 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms