Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSFP46459 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSFP46459 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSFP46459 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSFP46459 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSFP46459 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSFP46459 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSFP46459 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms