Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSBP45954 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSBP45954 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms