Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms