Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL3P36405 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL3P36405 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL3P36405 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL3P36405 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL3P36405 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL3P36405 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL3P36405 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL3P36405 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL3P36405 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL3P36405 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms