Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP6P35125 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP6P35125 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP6P35125 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP6P35125 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP6P35125 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP6P35125 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP6P35125 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP6P35125 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP6P35125 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms