Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC13P31276 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms