Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALDH4A1P30038 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALDH4A1P30038 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms