Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNGA1P29973 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGA1P29973 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms