Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB2P29033 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB2P29033 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB2P29033 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms