Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRMP28827 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PTPRMP28827 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
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