Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE1P24864 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE1P24864 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms