Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms