Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP100P23497 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP100P23497 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SP100P23497 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SP100P23497 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SP100P23497 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SP100P23497 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SP100P23497 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms