Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGA6P23229 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA6P23229 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms