Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNB1P20700 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms