Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms