Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM21P19474 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms