Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT15P19012 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT15P19012 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT15P19012 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT15P19012 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT15P19012 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT15P19012 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms