Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT1P17948 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT1P17948 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLT1P17948 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLT1P17948 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLT1P17948 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FLT1P17948 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms