Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA1P17302 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA1P17302 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA1P17302 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA1P17302 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA1P17302 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms