Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFRAP16234 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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