Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA1P15976 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA1P15976 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA1P15976 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA1P15976 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA1P15976 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA1P15976 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA1P15976 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms