Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM27P14373 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms