Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GLI4P10075 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GLI4P10075 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GLI4P10075 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GLI4P10075 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GLI4P10075 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms