Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms