Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RD3LP0DJH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms