Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD2P0DJD1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RGPD2P0DJD1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms