Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP10P09238 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP10P09238 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP10P09238 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP10P09238 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP10P09238 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP10P09238 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP10P09238 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP10P09238 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP10P09238 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP10P09238 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms