Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HSP90AB1P08238 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms