Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3P05106 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms