Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYBBP04839 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYBBP04839 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYBBP04839 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYBBP04839 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms