Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP29O95721 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP29O95721 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms