Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLSTN1O94985 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms