Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms