Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOX1O75936 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOX1O75936 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOX1O75936 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOX1O75936 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOX1O75936 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms