Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNKO75909 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNKO75909 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNKO75909 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNKO75909 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCNKO75909 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCNKO75909 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCNKO75909 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCNKO75909 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCNKO75909 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCNKO75909 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCNKO75909 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCNKO75909 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms