Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR5O75473 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGR5O75473 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGR5O75473 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGR5O75473 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGR5O75473 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGR5O75473 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR5O75473 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms