Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ3O43525 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms