Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP290O15078 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP290O15078 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP290O15078 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP290O15078 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP290O15078 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP290O15078 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP290O15078 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP290O15078 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP290O15078 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP290O15078 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP290O15078 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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