Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3EO15041 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
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